Articles populaires – Projet Python (BBSG)

11 décembre 2009

Introduction

Bonjour à tous!! Nous sommes deux élèves en M1 BBSG et ce blog est un complément à notre projet de programmation structurée en langage Python. Ici sera référencé une aide, une discussion et peut-être quelques autres catégories. En espérant que vous passerez...

Posté par nadiaETlaetitia à 19:55 - Commentaires […] - Permalien [#]

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11 décembre 2009

But du projet

Avant toute chose, nous allons vous présenter succintement le but de notre projet. Il faut analyser des données issues de profils de puces CGH. Celui-ci se découpe en cinq parties différentes (lecture des fichiers, algorithmique, validation des hypothèses...

Posté par nadiaETlaetitia à 20:33 - Commentaires […] - Permalien [#]

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11 décembre 2009

Aim

First, we're going to talk about the aim of our work. We have to analyse data from CGH chips. This work has five parts: reading file, algorithmic, validation of our hypothesis, comparison and graphic interface. Data come from DNA of tumourous cell of...

Posté par nadiaETlaetitia à 20:37 - Commentaires […] - Permalien [#]

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12 décembre 2009

Article d'aide

Utilisation du programme : Après avoir décompressé le fichier, le programme à lancer à partir d'un terminal est pucesCGH.py Vous trouverez ci dessous toute l'aide nécessaire afin de mieux comprendre le projet et sa structure. Données de départ : Les différents...

Posté par nadiaETlaetitia à 18:11 - Commentaires […] - Permalien [#]

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3 janvier 2010

Conclusion

Even if this work was complicated and asked time and energy, it completes our learning of Python language . Moreover, talking about DNA chips, it shows us an other side of a famous technical in genomics, genomics (and bioinformatics) toward which we hope...

Posté par nadiaETlaetitia à 17:22 - Commentaires […] - Permalien [#]

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17 décembre 2009

Discussion

A présent, voici la discussion qui pourra vous aider à mieux appréhender certains points de notre projet. Statistiques : En observant le nombre fragments supprimés ou multipliés pour chaque tumeur, il est déjà possible d'observer si ces valeurs sont proportionnelles...

Posté par nadiaETlaetitia à 18:24 - Commentaires […] - Permalien [#]

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18 décembre 2009

Discussion

A little discussion about our work in order to reflect a little bit. Statistics: Looking at the number of deleted or duplicated fragments, it's already possible to see if these data and the spreading of the tumour are proportional. Indeed the stage of...

Posté par nadiaETlaetitia à 12:38 - Commentaires […] - Permalien [#]

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3 janvier 2010

Conclusion

Bien que ce projet nous ait demandé beaucoup de temps et d'énergie, il nous a permis de compléter notre apprentissage du langage Python. De plus, traitant des puces à ADN, il nous a permis de voir un autre aspect d'une technique bien connue en génomique,...

Posté par nadiaETlaetitia à 17:09 - Commentaires […] - Permalien [#]

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12 décembre 2009

Help

How to use the programme : When you have uncompressed the file, the programme you have to open is CGHChip.py with a terminal. Here, it's an help for a best understanding of our work. Starting data: Different kind of data are: 0(no modification), 1(duplication),...

Posté par nadiaETlaetitia à 18:45 - Commentaires […] - Permalien [#]

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11 décembre 2009

Introduction

Welcome everybody! We're two students in bioinformatic and this blog is an addition for our work (Python language). Here, you can find help, discussion and, maybe, some other things. We hope we're enjoying here. Nadia and Laetitia.

Posté par nadiaETlaetitia à 19:56 - Commentaires […] - Permalien [#]

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